Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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HOXD13P35453 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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