Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRABP1P29762 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms