Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DUSP1P28562 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms