Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms