Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LOXP28300 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LOXP28300 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXP28300 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXP28300 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXP28300 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXP28300 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXP28300 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXP28300 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms