Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms