Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB2P26583 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms