Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPREP23469 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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