Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA1P21709 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms