Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCL3P20749 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms