Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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