Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR1P18146 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR1P18146 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR1P18146 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms