Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPB42P16452 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPB42P16452 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPB42P16452 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPB42P16452 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms