Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms