Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA4P12838 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms