Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms