Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms