Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CT47B1P0C2W7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CT47B1P0C2W7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms