Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms