Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms