Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSD2O96028 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSD2O96028 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSD2O96028 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSD2O96028 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms