Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATE1O95260 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATE1O95260 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms