Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF6O75683 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF6O75683 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms