Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms