Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSO75390 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSO75390 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSO75390 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSO75390 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSO75390 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSO75390 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSO75390 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSO75390 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms