Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms