Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms