Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAK2O60296 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms