Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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VEGFDO43915 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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VEGFDO43915 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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VEGFDO43915 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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VEGFDO43915 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VEGFDO43915 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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