Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXTL3O43909 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms