Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF14O43557 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms