Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBFA2T2O43439 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms