Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRGAP3O43295 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms