Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms