Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1G3V0Z9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms