Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms