Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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