Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms