Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXI3A8MTJ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms