Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM4A7MD48 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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