Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms