Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms