Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAV26-1A0A087WT03 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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