Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC61Q9Y6R9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms