Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms