Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KPTNQ9Y664 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms