Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SNX13Q9Y5W8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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