Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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