Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP11Q9Y3A2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP11Q9Y3A2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP11Q9Y3A2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP11Q9Y3A2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms