Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED16Q9Y2X0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED16Q9Y2X0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms